Il CII è in grado di proteggere le aree portuali ed assicurare un efficace sistema di sicurezza per il traffico merci e passeggeri:

I porti spesso situati in prossimità di città, assumono un ruolo essenziale del sistema logistico di trasporto, in quanto consentono il collegamento fra le rotte marittime e terrestri del commercio e del traffico passeggeri.
L’impatto delle minacce ordinarie o straordinarie per la sicurezza portuale è particolarmente rilevante ed appare in tutta la sua evidenza considerando che il 90% dei commerci esterni alla CE avviene via mare ed il 40% dei commerci interni all’UE avviene ugualmente via mare.